MTs Al-Multazam menyelenggarakan kurikulum terpadu antara Bidang Studi Umum (Kurikulum Kemenag) dan Bidang Studi Agama (Kurikulum Pesantren) yang berbasis Ahlu Sunnah Wal Jama'ah dalam satu sistem yang terpadu secara integral. Kurikulum yang diselenggarakan di Al-Multazam terbagi atas intra kurikuler, ko-kurikuler dan ekstra kurikuler.
Intra kurikuler merupakan kegiatan yang melibatkan tenaga pengajar secara langsung dengan sistem klasikal. Ko-Kurikuler merupakan kegiatan tambahan siswa (muatan lokal) yang wajib diikuti seperti muhadoroh tiga bahasa, kepramukaan, dll. Sedangkan ekstra kurikuler merupakan kegiatan yang boleh dipilih oleh siswa dengan tidak mengesampingkan intra maupun ko-kurikuler.
Dalam perjalanannya,kurikulum Al-Multazam senantiasa mengikuti dan mengadaptasikan diri dengan perkembangan kurikulum nasional, seperti telah diimplementasikannya KURMER (Kurikulum Merdeka) pada kelas VII, dan K13 (Kurikulum 2013) pada kelas VIII dan IX.